| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Ｖ・ファーレン長崎 | 27 | 12 | 14 |
| 2 | 清水エスパルス | 25 | 11 | 6 |
| 3 | ファジアーノ岡山 | 22 | 11 | 7 |
| 4 | 横浜ＦＣ | 18 | 11 | 8 |
| 5 | ヴァンフォーレ甲府 | 18 | 12 | 5 |
| 6 | ブラウブリッツ秋田 | 18 | 11 | 4 |
| 7 | 愛媛ＦＣ | 18 | 12 | 2 |
| 8 | ジェフユナイテッド千葉 | 17 | 12 | 10 |
| 9 | ベガルタ仙台 | 17 | 12 | 1 |
| 10 | いわきＦＣ | 16 | 11 | 10 |
| 11 | モンテディオ山形 | 16 | 11 | 0 |
| 12 | レノファ山口ＦＣ | 15 | 11 | 5 |
| 13 | 大分トリニータ | 13 | 11 | -1 |
| 14 | ロアッソ熊本 | 12 | 11 | -8 |
| 15 | 鹿児島ユナイテッドＦＣ | 12 | 11 | -8 |
| 16 | 栃木ＳＣ | 12 | 11 | -14 |
| 17 | 水戸ホーリーホック | 11 | 12 | -3 |
| 18 | 藤枝ＭＹＦＣ | 11 | 12 | -12 |
| 19 | 徳島ヴォルティス | 8 | 11 | -12 |
| 20 | ザスパ群馬 | 6 | 12 | -14 |
