| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ＦＣ町田ゼルビア | 71 | 35 | 36 |
| 2 | 清水エスパルス | 64 | 36 | 37 |
| 3 | ジュビロ磐田 | 62 | 36 | 21 |
| 4 | 東京ヴェルディ | 61 | 36 | 21 |
| 5 | ジェフユナイテッド千葉 | 57 | 36 | 4 |
| 6 | Ｖ・ファーレン長崎 | 55 | 36 | 9 |
| 7 | ファジアーノ岡山 | 54 | 36 | 7 |
| 8 | 大分トリニータ | 54 | 36 | -2 |
| 9 | ヴァンフォーレ甲府 | 53 | 36 | 6 |
| 10 | モンテディオ山形 | 52 | 36 | 4 |
| 11 | ザスパクサツ群馬 | 51 | 34 | 6 |
| 12 | 水戸ホーリーホック | 45 | 36 | -9 |
| 13 | 栃木ＳＣ | 42 | 36 | -3 |
| 14 | 藤枝ＭＹＦＣ | 42 | 35 | -11 |
| 15 | 徳島ヴォルティス | 41 | 36 | -8 |
| 16 | ブラウブリッツ秋田 | 41 | 35 | -9 |
| 17 | ロアッソ熊本 | 40 | 36 | 0 |
| 18 | ベガルタ仙台 | 40 | 36 | -12 |
| 19 | いわきＦＣ | 40 | 36 | -18 |
| 20 | レノファ山口 | 39 | 36 | -26 |
| 21 | ツエーゲン金沢 | 32 | 35 | -24 |
| 22 | 大宮アルディージャ | 30 | 36 | -29 |
