| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 清水エスパルス | 31 | 13 | 10 |
| 2 | Ｖ・ファーレン長崎 | 28 | 13 | 14 |
| 3 | 横浜ＦＣ | 24 | 13 | 12 |
| 4 | ファジアーノ岡山 | 23 | 13 | 6 |
| 5 | いわきＦＣ | 22 | 13 | 12 |
| 6 | ベガルタ仙台 | 20 | 13 | 2 |
| 7 | 愛媛ＦＣ | 19 | 13 | 2 |
| 8 | ブラウブリッツ秋田 | 19 | 13 | 2 |
| 9 | 大分トリニータ | 19 | 13 | 1 |
| 10 | レノファ山口ＦＣ | 18 | 13 | 5 |
| 11 | ヴァンフォーレ甲府 | 18 | 13 | 4 |
| 12 | ジェフユナイテッド千葉 | 17 | 13 | 9 |
| 13 | モンテディオ山形 | 17 | 13 | -1 |
| 14 | 藤枝ＭＹＦＣ | 14 | 13 | -11 |
| 15 | ロアッソ熊本 | 13 | 13 | -9 |
| 16 | 鹿児島ユナイテッドＦＣ | 13 | 13 | -9 |
| 17 | 徳島ヴォルティス | 12 | 13 | -11 |
| 18 | 栃木ＳＣ | 12 | 13 | -18 |
| 19 | 水戸ホーリーホック | 11 | 13 | -5 |
| 20 | ザスパ群馬 | 6 | 13 | -15 |
