| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 清水エスパルス | 37 | 16 | 15 |
| 2 | Ｖ・ファーレン長崎 | 33 | 16 | 17 |
| 3 | 横浜ＦＣ | 28 | 16 | 13 |
| 4 | いわきＦＣ | 26 | 16 | 12 |
| 5 | ベガルタ仙台 | 26 | 15 | 4 |
| 6 | ジェフユナイテッド千葉 | 24 | 16 | 16 |
| 7 | レノファ山口ＦＣ | 24 | 15 | 8 |
| 8 | ファジアーノ岡山 | 24 | 15 | 5 |
| 9 | ヴァンフォーレ甲府 | 22 | 15 | 5 |
| 10 | ブラウブリッツ秋田 | 22 | 16 | 2 |
| 11 | 大分トリニータ | 22 | 16 | 1 |
| 12 | 愛媛ＦＣ | 21 | 16 | -4 |
| 13 | 藤枝ＭＹＦＣ | 20 | 15 | -9 |
| 14 | 水戸ホーリーホック | 18 | 16 | -2 |
| 15 | 徳島ヴォルティス | 18 | 16 | -10 |
| 16 | モンテディオ山形 | 17 | 16 | -6 |
| 17 | ロアッソ熊本 | 17 | 16 | -10 |
| 18 | 鹿児島ユナイテッドＦＣ | 13 | 16 | -17 |
| 19 | 栃木ＳＣ | 12 | 15 | -20 |
| 20 | ザスパ群馬 | 6 | 16 | -20 |
