| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ＦＣ町田ゼルビア | 87 | 42 | 44 |
| 2 | ジュビロ磐田 | 75 | 42 | 30 |
| 3 | 東京ヴェルディ | 75 | 42 | 26 |
| 4 | 清水エスパルス | 74 | 42 | 44 |
| 5 | モンテディオ山形 | 67 | 42 | 10 |
| 6 | ジェフユナイテッド千葉 | 67 | 42 | 8 |
| 7 | Ｖ・ファーレン長崎 | 65 | 42 | 14 |
| 8 | ヴァンフォーレ甲府 | 64 | 42 | 10 |
| 9 | 大分トリニータ | 62 | 42 | -2 |
| 10 | ファジアーノ岡山 | 58 | 42 | 0 |
| 11 | ザスパクサツ群馬 | 57 | 42 | 0 |
| 12 | 藤枝ＭＹＦＣ | 52 | 42 | -11 |
| 13 | ブラウブリッツ秋田 | 51 | 42 | -7 |
| 14 | ロアッソ熊本 | 49 | 42 | -1 |
| 15 | 徳島ヴォルティス | 49 | 42 | -10 |
| 16 | ベガルタ仙台 | 48 | 42 | -13 |
| 17 | 水戸ホーリーホック | 47 | 42 | -17 |
| 18 | いわきＦＣ | 47 | 42 | -24 |
| 19 | 栃木ＳＣ | 44 | 42 | -8 |
| 20 | レノファ山口 | 44 | 42 | -30 |
| 21 | 大宮アルディージャ | 39 | 42 | -34 |
| 22 | ツエーゲン金沢 | 35 | 42 | -29 |
