| 順位 | チーム | 勝点 | 試合数 | 得失差 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | ＦＣ町田ゼルビア | 71 | 36 | 35 |
| 2 | ジュビロ磐田 | 65 | 37 | 22 |
| 3 | 清水エスパルス | 64 | 37 | 35 |
| 4 | 東京ヴェルディ | 62 | 37 | 21 |
| 5 | ジェフユナイテッド千葉 | 60 | 37 | 9 |
| 6 | ヴァンフォーレ甲府 | 56 | 37 | 7 |
| 7 | Ｖ・ファーレン長崎 | 55 | 37 | 8 |
| 8 | ファジアーノ岡山 | 54 | 37 | 2 |
| 9 | 大分トリニータ | 54 | 37 | -3 |
| 10 | ザスパクサツ群馬 | 53 | 36 | 6 |
| 11 | モンテディオ山形 | 52 | 37 | 3 |
| 12 | 藤枝ＭＹＦＣ | 45 | 36 | -9 |
| 13 | 水戸ホーリーホック | 45 | 37 | -10 |
| 14 | 徳島ヴォルティス | 44 | 38 | -8 |
| 15 | ブラウブリッツ秋田 | 44 | 36 | -8 |
| 16 | ロアッソ熊本 | 43 | 38 | 0 |
| 17 | ベガルタ仙台 | 43 | 37 | -11 |
| 18 | いわきＦＣ | 43 | 37 | -17 |
| 19 | 栃木ＳＣ | 42 | 37 | -4 |
| 20 | レノファ山口 | 42 | 37 | -25 |
| 21 | ツエーゲン金沢 | 33 | 37 | -25 |
| 22 | 大宮アルディージャ | 33 | 37 | -28 |
